No entanto, a especificidade é difícil de alcançar devido à complexidade do espectro de absorção e ao fato de que as diferenças importantes entre os agentes de ameaça biológica estão contidas no núcleo e não respondem à absorção. Além disso, os comprimentos de onda necessários para a identificação de agentes específicos estão na região ultravioleta do espectro e representam um risco à segurança. Mesmo assim, o LIDAR pode ser usado como um contador de partículas e sistema de dimensionamento para identificar remotamente a presença de uma nuvem de partículas (sem assinatura química). Existem sistemas que exploram o tamanho, a forma e a distribuição do tamanho das partículas da nuvem para indicar a presença potencial de um elemento biológico. Os sistemas LIDAR para agentes biológicos e químicos são sofisticados e operam com algoritmos igualmente sofisticados. Eles necessitam de manutenção frequente e têm requisitos de energia consideráveis. Em áreas urbanas e alguns outros locais, a poluição atmosférica ou “poluição do ar” é alta, o que pode comprometer a relação sinal-ruído.
Um método relacionado ao LIDAR é a absorção por transformada de Fourier no infravermelho (FTIR) de caminho aberto ou fechado, que pode ser potencialmente usada como um método de sensoriamento remoto. A absorção no infravermelho pode ser usada para sensoriamento químico, embora a análise e interpretação dos dados sejam desafiadoras, conforme resumido em Vogt (2006). Os problemas de manutenção, energia e desenvolvimento de algoritmos para FTIR são semelhantes aos do LIDAR.
A detecção química remota poderia ser usada no exterior de um edifício para determinar a presença ou ausência de uma nuvem química a quilômetros de distância.